電氣兩用殺菌鍋使用時候將灌裝好的產品裝籃送入滅菌釜中，釜門關閉。然后釜門通過三重安全聯鎖保證安全。在整個滅菌過程中，門是以機械方式鎖緊的。 電氣兩用殺菌鍋使用滅菌過程按照輸入微處理控制器PLC的數據自動進行。
在電氣兩用殺菌鍋的底部保留適量的水。如果需要，這部分水可在升溫的開始階段，自動注入。對于熱灌裝的產品，這部分水可以在熱水罐中首先預熱然后注入，在整個滅菌過程中，這部分水通過高流量泵反復循環，自上而下地對產品進行噴淋加熱。蒸汽通過熱交換器的另一個回路，根據溫度設定值，對溫度進行調整。然后，殺菌鍋使用水流通過滅菌釜頂部的分布盤均勻地、自上而下地淋在整個產品的表面。這樣就保證了熱量的均勻分布。淋洗過產品的水在容器底部收集，并經過過濾器和收集管后流出。
在升溫和滅菌期間，由程序自動的控制閥門，將蒸汽導入熱交換器的初級回路中。冷凝水自動地從疏水閥中排出。由于冷凝水未受污染，可被輸送回鍋爐中使用。
在冷卻階段，電氣兩用殺菌鍋使用向熱交換器的初始回路中注入冷水。冷水由位于熱交換器入口的自動閥調節，通過程序控制。由于冷卻水不與容器內部接觸，因此未被污染，可被重復使用。
在整個過程中，電氣兩用殺菌鍋內部的壓力是由程序通過兩個自動閥對滅菌釜送入或排出壓縮空氣來進行控制的。
當滅菌結束時，電氣兩用殺菌鍋使用會發出報警信號。此時可開門并卸料。隨后準備對下一批產品進行滅菌。
電氣兩用殺菌鍋選擇原則
1、主要從控溫精度和熱分布均勻性上進行選擇，若產品要求溫度很嚴格，尤其是出口產品，因為要求熱分布很均勻，所以應盡量選擇電腦全自動殺菌鍋。電腦半自動殺菌鍋溫度控制、壓力控制與電腦全自動相同，但是價格卻是電腦全自動的1/3。一般要求可以選擇電氣半自動殺菌鍋。手動殺菌鍋殺菌難度高，控溫和控壓等都由人工完成，食品外觀很難掌握，漲罐（袋）和破碎率高。
2、若產品是含氣包裝或者產品外觀比較要求比較嚴格，則應選擇電腦全自動或電腦半自動殺菌鍋。
3、若產品是玻璃瓶或馬口鐵，因為升溫和降溫速度都要求可以控制，所以盡量不應選擇雙層殺菌鍋。
4、若從節約能源考慮，可選擇雙層殺菌鍋，其特點是上罐是熱水罐，下罐是處理罐，上罐的熱水重復使用，可節約大量蒸汽，適合每天產量超過10噸的食品生產企業。
5、若產量較小或者沒有鍋爐，則可以考慮使用電汽兩用殺菌鍋，其原理是蒸汽由下罐電加熱產生，上罐滅菌。
6、若產品粘稠度很高，電氣兩用殺菌鍋的殺菌過程中產品需要旋轉，則應選擇選擇旋轉式殺菌。
